El primer análisis de cohorte del autismo africano revela millones de nuevas variantes


Espectro completo: el aumento de la diversidad en los estudios genéticos puede ayudar a los investigadores a comprender mejor el autismo. kate_sept2004 / iStock


POR LAURA DATTARO

Fuente: Spectrum / 29/10/2020

Fotografía: kate_sept2004 / iStock

Las secuencias del genoma de una de las primeras cohortes de investigación de niños africanos con autismo y sus familias, han revelado más de 4 millones de nuevas variantes genéticas, algunas de las cuales se producen en genes no vinculados previamente a la afección.

Los investigadores presentaron los resultados inéditos el lunes en la conferencia de la Sociedad Americana de Genética Humana 2020, que se celebra telemáticamente a causa de la pandemia de coronavirus.

La investigación sobre la genética del autismo, al igual que la investigación genética en general, se ha centrado de manera abrumadora en las personas de ascendencia europea. Lo que los investigadores aprenden del estudio de esas poblaciones puede aplicarse a todas las personas autistas, pero crea un "lente estrecho" para comprender la condición, dice la investigadora principal Maria Chahrour, profesora adjunta de genética y neurociencia de la Universidad de Texas Southwestern en Dallas.

"Como comunidad genética, reconocemos esta necesidad masiva de diversidad en los estudios genómicos", dice Chahrour. "La pérdida de la diversidad genética en los estudios actuales limita el alcance de nuestra comprensión."

En 2015, Chahrour comenzó a reclutar participantes de las diversas poblaciones de Dallas para estudiar la genética del autismo. Escuchó a personas de muchos orígenes, incluidas familias que habían emigrado recientemente de África.

Sin embargo, a algunos les preocupaba la privacidad de sus datos genéticos, las injusticias raciales cometidas en el pasado por los investigadores y los proveedores de servicios médicos, y el estigma contra el autismo en sus comunidades, dice Chahrour. Querían participar en un estudio en el que pudieran ayudar a crear las normas.

Así que Chahrour diseñó el nuevo estudio en estrecha colaboración con una mujer de la cohorte y el Joy Autism Center de Addis Abeba (Etiopía).

Nuevas variantes


El grupo de Chahrour de 116 participantes incluye 31 personas con autismo - 7 de ellas niñas - y sus hermanos y padres. Todas las familias viven en los Estados Unidos, pero han inmigrado de África, en su mayoría de Etiopía o Eritrea. Una familia es de Kenya.

Entre los niños autistas, 11 tienen discapacidad intelectual, 8 tienen el trastorno por déficit de atención e hiperactividad y 3 sufren convulsiones.

Chahrour y su equipo secuenciaron todo el genoma de cada persona de la cohorte. Encontraron más de 4 millones de variantes que nunca antes habían sido reportadas en las bases de datos genéticas. Algunas de estas variantes ocurren en genes que no han sido vinculados previamente con el autismo u otras condiciones de desarrollo neurológico, ofreciendo nuevos genes de riesgo potencial para que los investigadores los investiguen.

"Esto se debe puramente a la falta de secuenciación de las poblaciones africanas", dice Chahrour.

Utilizaron una técnica llamada "mapeo de mezclas" que puede analizar los orígenes de variantes de distintos linajes, en este caso, africanos y euroasiáticos. La cartografía podría ayudar a los investigadores a identificar las áreas del genoma que son relevantes para el autismo y que son específicas de las personas de ascendencia africana.

Es bueno que los investigadores estén agregando nuevas poblaciones a los estudios genéticos, dice Stormy Chamberlain, profesor adjunto de genética y ciencias del genoma de la Universidad de Connecticut en Farmington, que no participó en el trabajo. Pero para entender cuán rara es una variante y si contribuye al autismo, los investigadores tendrán que comparar su cohorte con un gran grupo de personas no autóctonas de ascendencia similar, dice.

Los esfuerzos para crear tales cohortes incluyen un reciente análisis del genoma completo de 426 personas de 50 grupos etnolingüísticos diferentes de África, que encontró 3 millones de nuevas variantes genéticas (1).

Chahrour tiene previsto seguir agregando familias a su cohorte y explorar la función de las variantes y los genes identificados hasta ahora.

El aumento de la representación de las poblaciones africanas en la investigación genética podría ayudar en última instancia a que más personas obtengan un diagnóstico genético para su autismo, dice. También puede ampliar los conocimientos de los investigadores sobre la enfermedad, en particular dada la gran diversidad genética de las personas del continente.

"El estudio pone de relieve el poder de la genómica africana para informar sobre trastornos complejos", dice Chahrour. "Al observar sólo una población en particular, como hemos estado haciendo, eso deja incompleto todo el panorama de la diversidad genética humana".

REFERENCIAS

1. Choudhury A. et al. Nature 586, 741-748 (2020).

TAGS: ASHG 2020, autismo, ética, secuenciación, secuenciación del genoma completo

https://www.spectrumnews.org/news/first-analysis-of-african-autism-cohort-reveals-millions-of-new-variants/?utm_source=Spectrum+Newsletters&utm_campaign=4452d9ba40-EMAIL_CAMPAIGN_2020_10_28_04_32&utm_medium=email&utm_term=0_529db1161f-4452d9ba40-168813249

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