Un análisis masivo puntúa la sensibilidad de los genes a las mutaciones

Clasificación y archivo: Un nuevo recurso que recopila las deleciones y duplicaciones vinculadas a 30 rasgos del neurodesarrollo puede ayudar a los investigadores y clínicos a interpretar los resultados genéticos.

POR LAURA DATTARO

Fuente: Spectrum | 05/05/2021

Fotografía: Autism Spectrum

Se han identificado 49 áreas del genoma en las que las mutaciones se asocian a las condiciones del neurodesarrollo, incluido el autismo.

Los investigadores han clasificado más de 17.000 genes en función de su sensibilidad a las mutaciones que los eliminan o duplican, basándose en un análisis inédito de los datos genéticos de más de 750.000 personas. El análisis también identificó 49 áreas del genoma en las que las mutaciones se asocian a las condiciones del neurodesarrollo, incluido el autismo.

Los investigadores presentaron ayer los resultados de forma virtual en la reunión anual de la 2021 International Society for Autism Research.

Las mutaciones conocidas como variaciones en el número de copias (VNC) se producen cuando un tramo de ADN se repite o falta en un cromosoma. Las VNC son una de las causas genéticas más comunes del autismo, pero como pueden abarcar cientos de miles de pares de bases, a menudo no está claro qué genes contribuyen más a los rasgos de una persona.

Las puntuaciones del nuevo estudio indican la intensidad con la que una supresión o duplicación afectaría a la función de cada uno de los genes y la gravedad del resultado del neurodesarrollo, lo que podría ser útil tanto para los investigadores como para los médicos, afirma el investigador del estudio Ryan Collins, estudiante de posgrado del laboratorio de Michael Talkowski en la Universidad de Harvard.

Otros investigadores ya han expresado su interés en incorporar estas puntuaciones a sus propios análisis para ayudar a interpretar los resultados genéticos, afirma Collins.

"Estas puntuaciones son realmente útiles para interpretar la variación genética en el contexto de la genética médica e incluso, de cara al futuro, para el diagnóstico clínico", afirma.

Un enorme conjunto de datos:

Collins y sus colegas recopilaron datos genéticos de 13 fuentes que cubrían 30 rasgos de neurodesarrollo y neuropsiquiátricos, incluidos los rasgos de autismo, los síntomas de esquizofrenia y las convulsiones. La muestra incluía a 753.994 personas, de las cuales 293.235 tenían al menos uno de los rasgos.

El equipo encontró 49 segmentos del genoma, cada uno de ellos con una longitud mínima de 200.000 pares de bases, en los que las VNC se asocian a trastornos del neurodesarrollo. Algunos segmentos contenían genes asociados por primera vez a estas enfermedades, como el CBLN2, que codifica para una proteína que se expresa en las sinapsis.

También identificaron nuevas funciones para algunos genes que se sabía que estaban implicados en el neurodesarrollo. Por ejemplo, se sabe que una mutación de un solo par de bases en el gen SMARCA2 causa una forma de discapacidad intelectual llamada síndrome de Nicolaides-Baraitser, pero el nuevo trabajo reveló que las deleciones en el gen también están asociadas a otros trastornos del neurodesarrollo.

"Mirar la genética desde diferentes perspectivas puede llevarte a los mismos genes, pero lo que te dicen sobre esos genes es más importante que sólo considerar un tipo de variante genética u otra", dice Collins.

Los investigadores utilizaron el aprendizaje automático para crear puntuaciones de sensibilidad para 17.263 de los aproximadamente 20.000 genes del genoma humano. Casi 3.300 son sensibles a las deleciones y duplicaciones que pueden provocar una condición de neurodesarrollo.

El equipo sigue acumulando nuevos datos y tiene resultados preliminares de un análisis de más de un millón de personas, dice Collins.

Lea más informes de la reunión anual de 2021 de la Sociedad Internacional para la Investigación del Autismo.

https://www.spectrumnews.org/news/massive-analysis-scores-genes-sensitivity-to-mutations/